アルファ付きファイルを作成する際は、対応するエクスポーターを選択した上で詳細設定の変更が必要になります。以下の手順でエクスポートを行ってください。

1) エクスポート画面を開きます。
2) アルファ付きファイル対応のエクスポーターを選択します。
3) 「変換処理を有効にする」にチェックをつけます。
4) 「ビデオフォーマットの変換」にチェックをつけます。
5) 「チャンネル」で カラー から カラー + アルファ へ切り替えます。
6) 必要に応じてその他のパラメーターを調整し、エクスポートします。